Bos taurus Gene: NOD2 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-631640.3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | NOD2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Gene Name | Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Synonyms | CARD15 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species | Bos taurus | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSBTAG00000020936 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] NOD2 and NOD1 represent central players in the control of the immune responses to bacterial infections and inflammation.
[Homo sapiens] NOD2 is an intracellular receptor of muramyl dipeptide (MDP), a component of peptidoglycan present in the cell wall of Gram-positive (G+) and Gram-negative (G-) bacteria.
[Homo sapiens] NOD2 and NOD1 can induce CCL5 (RANTES) through NF-kappaB pathway, orchestrating the global Nod-dependent immune defence during bacterial infections.
[Homo sapiens] NOD2-dependent recognition of S. aureus and muramyl dipeptide is facilitated by alpha-toxin (alpha-hemolysin), a pore-forming toxin and virulence factor of the pathogen and is dependent on IL-1beta-amplified production of IL-6.
[Homo sapiens] NOD2 and NOD1 direct autophagy by recruiting ATG16L1 to the plasma membrane at the site of bacterial entry.
[Homo sapiens] NOD2 stimulation induces autophagy in dendritic cells influencing bacterial handling and antigen presentation.
[Homo sapiens] NOD2 recruits the critical autophagy protein ATG16L1 to the plasma membrane during bacterial invasion.
[Homo sapiens] NOD2 functions as a cytoplasmic viral pattern-recognition receptor (PRR) and activates an innate immune responses to viral ssRNA by triggering activation of interferon-regulatory factor 3 (IRF3) and production of interferon-beta (IFNB1).
[Homo sapiens] NOD2 is both a positive and negative regulator of TLR4 - the effect it exerts is dependent on the presence of MDP. NOD2 upon engagement with its ligand, MDP, positively regulates TLR4-mediated signalling; in the absence of MDP, NOD2 negatively regulates the TLR4 pathway. (Demonstrated in murine model)
[Homo sapiens] NOD2 is a peripheral peptidoglycan intracellular sensor and is important for the progression and pathogenesis of experimental autoimmune encephalomyelitis (animal model of multiple sclerosis).
[Homo sapiens] NOD2 detects heat-killed Legionella pneumophila and stimulates NFkB and IFN-beta promoter activity. NOD2 deficiency results in increased proinflammatory cytokine expression at 4hrs and greater neutrophil recruitment to the lung. (Demonstrated in murine model)
[Homo sapiens] DDX58 and NOD2 colocalize to cellular ruffles and cell-cell junctions to form a protein complex via the CARD domains. DDX58 negatively regulates ligand-induced NFkB signalling mediated by NOD2, and conversely, NOD2 negatively regulates type I interferon induction by DDX58.
[Homo sapiens] NOD2 recognition of muramyl dipeptide, a component of bacterial cell walls, improves the barrier function of intestinal epithelial cells. (Demonstrated in mice)
[Homo sapiens] NOD2 enhances the innate immune response of alveolar macrophages to Mycobacterium tuberculosis in human.
[Homo sapiens] Following NOD2 activation, IRF4 interacts with MYD88, TRAF6, and RIPK2 and downregulates K63-linked polyubiquitinylation of RICK and TRAF6 leading to disruption of NFkB activation pathways.
[Homo sapiens] NOD2 plays a role in intestinal innate immunity by regulating the expression of DEFA5 and DEFA6 through the NF-kB and MAPK pathways.
[Mus musculus] Nod2-deficient mice have impaired resistance to Mycobacterium tuberculosis infection through defective innate and adaptive immunity.
[Mus musculus] Nod2 functions in non-hematopoietic cells of the small intestinal crypts and this is critical for protecting mice from a Th1-driven granulomatous inflammation in the ilum.
[Mus musculus] Nod2 and Nod1 account for neutrophil recruitment to the lungs of mice infected with Legionella pneumophila.
[Mus musculus] Nod2 and Nod1 activation results in substantial secretion of Ccl5 by murine macrophages and induces binding of NF-kappaB subunits to Ccl5 promoter.
[Mus musculus] Nod2 and Nod1 can detect Legionella pneumophila and these receptors modulate the in vivo pulmonary immune response differently.
[Mus musculus] Nod2 is both a positive and negative regulator of Tlr4 - the effect it exerts is dependent on the presence of MDP. Nod2 upon engagement with its ligand, MDP, positively regulates Tlr4-mediated signaling; in the absence of MDP, Nod2 negatively regulates the Tlr4 pathway.
[Mus musculus] Nod2 is a peripheral peptidoglycan intracellular sensor and is important for the progression and pathogenesis of experimental autoimmune encephalomyelitis (animal model of multiple sclerosis).
[Mus musculus] Nod2 detects heat-killed Legionella pneumophila and stimulates NFkB and IFN-beta promoter activity. Nod2 deficiency results in increased proinflammatory cytokine expression at 4hrs and greater neutrophil recruitment to the lung.
[Mus musculus] Ddx58 and Nod2 colocalize to cellular ruffles and cell-cell junctions to form a protein complex via the CARD domains. Ddx58 negatively regulates ligand-induced NFkB signalling mediated by Nod2, and conversely, Nod2 negatively regulates type I interferon induction by Ddx58. (Demonstrated in human)
[Mus musculus] Nod2 recognition of muramyl dipeptide, a component of bacterial cell walls, improves the barrier function of intestinal epithelial cells.
[Mus musculus] Nod2 enhances the innate immune response of alveolar macrophages to Mycobacterium tuberculosis in human. (Demonstrated in human)
[Mus musculus] Nod1 and Nod2 synergize with Tlr4 in dendritic cells to increase IL12 production and enhance invariant natural killer T (iNKT) cell activation, and are important regulators of the IFN gamma response by iNKT cells during S. typhimurium and L. monocytogenes infections.
[Mus musculus] Salmonella enterica serovar Typhimurium Î?msbB that possesses a modified lipid A triggers exacerbated colitis in the absence of Nod1 and/or Nod2, which is likely due to increased Tlr2 stimulation.
[Mus musculus] Nod2 regulates type-1 cytokine responses to Mycobacterium avium but is not required for the control of M. avium infection in vivo.
[Mus musculus] Leukotriene B4 acts on Nod2 pathway to enhance the immune response against influenza A infection.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000167207:
This gene is a member of the Nod1/Apaf-1 family and encodes a protein with two caspase recruitment (CARD) domains and six leucine-rich repeats (LRRs). The protein is primarily expressed in the peripheral blood leukocytes. It plays a role in the immune response to intracellular bacterial lipopolysaccharides (LPS) by recognizing the muramyl dipeptide (MDP) derived from them and activating the NFKB protein. Mutations in this gene have been associated with Crohn disease and Blau syndrome. [provided by RefSeq, Jul 2008] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 18:19181972-19212607 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Strand | Forward strand | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Band | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Transcripts |
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Interactions | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 0 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 41 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Mus musculus
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Gene ID
Gene Order
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Pathways | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
NOD1/2 Signaling Pathway pathway
Toll Like Receptor 2 (TLR2) Cascade pathway
TRIF-mediated TLR3/TLR4 signaling pathway
Toll Like Receptor 3 (TLR3) Cascade pathway
Activated TLR4 signalling pathway
Toll Like Receptor 7/8 (TLR7/8) Cascade pathway
MyD88-independent cascade pathway
activated TAK1 mediates p38 MAPK activation pathway
Toll Like Receptor 9 (TLR9) Cascade pathway
MyD88:Mal cascade initiated on plasma membrane pathway
Toll Like Receptor 5 (TLR5) Cascade pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Immune System pathway
MAP kinase activation in TLR cascade pathway
JNK (c-Jun kinases) phosphorylation and activation mediated by activated human TAK1 pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
Nucleotide-binding domain, leucine rich repeat containing receptor (NLR) signaling pathways pathway
Toll Like Receptor 10 (TLR10) Cascade pathway
Toll Like Receptor TLR6:TLR2 Cascade pathway
TRAF6 mediated induction of NFkB and MAP kinases upon TLR7/8 or 9 activation pathway
Toll Like Receptor TLR1:TLR2 Cascade pathway
MyD88 dependent cascade initiated on endosome pathway
TAK1 activates NFkB by phosphorylation and activation of IKKs complex pathway
Innate Immune System pathway
Interleukin-1 signaling pathway
Signaling by Interleukins pathway
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade pathway
MyD88 cascade initiated on plasma membrane pathway
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KEGG | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
REACTOME |
JNK (c-Jun kinases) phosphorylation and activation mediated by activated human TAK1 pathway
activated TAK1 mediates p38 MAPK activation pathway
TAK1 activates NFkB by phosphorylation and activation of IKKs complex pathway
MyD88-independent cascade pathway
Toll Like Receptor 3 (TLR3) Cascade pathway
MyD88:Mal cascade initiated on plasma membrane pathway
Toll Like Receptor TLR1:TLR2 Cascade pathway
Toll Like Receptor TLR6:TLR2 Cascade pathway
TRAF6 mediated induction of NFkB and MAP kinases upon TLR7/8 or 9 activation pathway
MyD88 dependent cascade initiated on endosome pathway
Toll Like Receptor 9 (TLR9) Cascade pathway
MyD88 cascade initiated on plasma membrane pathway
Toll Like Receptor 10 (TLR10) Cascade pathway
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade pathway
Toll Like Receptor 5 (TLR5) Cascade pathway
NOD1/2 Signaling Pathway pathway
Interleukin-1 signaling pathway
Toll Like Receptor 7/8 (TLR7/8) Cascade pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Innate Immune System pathway
Toll Like Receptor 2 (TLR2) Cascade pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
MAP kinase activation in TLR cascade pathway
Nucleotide-binding domain, leucine rich repeat containing receptor (NLR) signaling pathways pathway
Immune System pathway
Signaling by Interleukins pathway
Activated TLR4 signalling pathway
TRIF-mediated TLR3/TLR4 signaling pathway
Toll Like Receptor 3 (TLR3) Cascade pathway
TRAF6 mediated induction of NFkB and MAP kinases upon TLR7/8 or 9 activation pathway
Toll Like Receptor 2 (TLR2) Cascade pathway
Innate Immune System pathway
JNK (c-Jun kinases) phosphorylation and activation mediated by activated human TAK1 pathway
MyD88 cascade initiated on plasma membrane pathway
Cytokine Signaling in Immune system pathway
Toll Like Receptor TLR1:TLR2 Cascade pathway
MAP kinase activation in TLR cascade pathway
Immune System pathway
Toll Like Receptor 5 (TLR5) Cascade pathway
Toll Like Receptor TLR6:TLR2 Cascade pathway
activated TAK1 mediates p38 MAPK activation pathway
Toll Like Receptor 9 (TLR9) Cascade pathway
Toll-Like Receptors Cascades pathway
Signaling by Interleukins pathway
NOD1/2 Signaling Pathway pathway
MyD88 dependent cascade initiated on endosome pathway
Nucleotide-binding domain, leucine rich repeat containing receptor (NLR) signaling pathways pathway
Activated TLR4 signalling pathway
Interleukin-1 signaling pathway
MyD88-independent cascade pathway
Toll Like Receptor 7/8 (TLR7/8) Cascade pathway
MyD88:Mal cascade initiated on plasma membrane pathway
TRIF-mediated TLR3/TLR4 signaling pathway
TAK1 activates NFkB by phosphorylation and activation of IKKs complex pathway
Toll Like Receptor 10 (TLR10) Cascade pathway
Toll Like Receptor 4 (TLR4) Cascade pathway
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KEGG |
NOD-like receptor signaling pathway pathway
Shigellosis pathway
NOD-like receptor signaling pathway pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
PID NCI |
Canonical NF-kappaB pathway
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Cross-References | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
SwissProt | Q6E804 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | 444867 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
UniGene | Bt.30778 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001002889 XM_005218467 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HUGO | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
CCDS | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
EMBL | AY518737 AY518739 AY518740 AY518741 AY518742 AY518743 AY518744 AY518745 AY518746 AY518747 AY518748 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
GenPept | AAS09824 AAS09826 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | 444867 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||