Mus musculus Gene: Eftud2 | |||||||||||||||||||||||
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Summary | |||||||||||||||||||||||
InnateDB Gene | IDBG-212804.6 | ||||||||||||||||||||||
Last Modified | 2014-10-13 [Report errors or provide feedback] | ||||||||||||||||||||||
Gene Symbol | Eftud2 | ||||||||||||||||||||||
Gene Name | elongation factor Tu GTP binding domain containing 2 | ||||||||||||||||||||||
Synonyms | 116kDa; Snrp116; U5-116kD | ||||||||||||||||||||||
Species | Mus musculus | ||||||||||||||||||||||
Ensembl Gene | ENSMUSG00000020929 | ||||||||||||||||||||||
Encoded Proteins |
elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
elongation factor Tu GTP binding domain containing 2
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Protein Structure | |||||||||||||||||||||||
Useful resources | Stemformatics EHFPI ImmGen | ||||||||||||||||||||||
InnateDB Annotation from Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Summary |
[Homo sapiens] EFTUD2 is a novel innate immune regulator that restricts hepatitis C virus infection through an RIG-I/MDA5-mediated, JAK-STAT-independent pathway.
[Homo sapiens] EFTUD2 is a novel innate immune antiviral regulator that restricts hepatitis C virus infection through a DDX58/IFIH1-mediated, JAK-STAT-independent pathway.
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Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
Summary |
This gene does not have any Entrez summary - the following is the summary from its human ortholog ENSG00000108883:
This gene encodes a GTPase which is a component of the spliceosome complex which processes precursor mRNAs to produce mature mRNAs. Mutations in this gene are associated with mandibulofacial dysostosis with microcephaly. Multiple transcript variants encoding different isoforms have been found for this gene. [provided by RefSeq, Apr 2012] |
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Gene Information | |||||||||||||||||||||||
Type | Protein coding | ||||||||||||||||||||||
Genomic Location | Chromosome 11:102838473-102880985 | ||||||||||||||||||||||
Strand | Reverse strand | ||||||||||||||||||||||
Band | E1 | ||||||||||||||||||||||
Transcripts | |||||||||||||||||||||||
Interactions | |||||||||||||||||||||||
Number of Interactions |
This gene and/or its encoded proteins are associated with 15 experimentally validated interaction(s) in this database.
They are also associated with 92 interaction(s) predicted by orthology.
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Gene Ontology | |||||||||||||||||||||||
Molecular Function |
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Biological Process |
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Cellular Component |
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Orthologs | |||||||||||||||||||||||
Species
Homo sapiens
Bos taurus
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Gene ID
Gene Order
Not yet available
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Pathways | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Gene Expression pathway
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Pathway Predictions based on Human Orthology Data | |||||||||||||||||||||||
NETPATH | |||||||||||||||||||||||
REACTOME |
mRNA Splicing - Major Pathway pathway
mRNA Splicing - Minor Pathway pathway
Processing of Capped Intron-Containing Pre-mRNA pathway
mRNA Splicing pathway
Gene Expression pathway
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KEGG |
Spliceosome pathway
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INOH | |||||||||||||||||||||||
PID NCI | |||||||||||||||||||||||
Cross-References | |||||||||||||||||||||||
SwissProt | |||||||||||||||||||||||
TrEMBL | |||||||||||||||||||||||
UniProt Splice Variant | |||||||||||||||||||||||
Entrez Gene | |||||||||||||||||||||||
UniGene | |||||||||||||||||||||||
RefSeq | NM_001109995 NM_011431 XM_006532665 | ||||||||||||||||||||||
OMIM | |||||||||||||||||||||||
CCDS | CCDS48947 CCDS48948 | ||||||||||||||||||||||
HPRD | |||||||||||||||||||||||
IMGT | |||||||||||||||||||||||
MGI ID | |||||||||||||||||||||||
MGI Symbol | |||||||||||||||||||||||
EMBL | |||||||||||||||||||||||
GenPept | |||||||||||||||||||||||
RNA Seq Atlas | |||||||||||||||||||||||